收藏｜史上最全高质量SCI图片处理软件及操作流程

xiangtingsl · 发表于 2023-1-5 09:18

相信有投稿经验的朋友都知道期刊对图片质量的要求很高，只要图片做得稍微不清晰，期刊编辑部马上退稿重做。有些审稿专家还习惯了先看标题和图表，再看正文。
一幅图等于1000字，可见SCI论文的图片质量非常重要，处理一张图片可能要花很多时间，图片质量好坏一定程度上决定了论文能不能被录用。
在座的科研大牛，你们千辛万苦地做出来了实验结果，该怎样展现给别人看呢？高颜值的SCI图片怎么弄呢？有秘诀吗？下面小编将介绍一些组合SCI图片所用的软件及其操作流程。

什么是图像呢？
图像是一个数组或矩阵，由方形像素按列和行排列起来。我们常见的图像有黑白图像和彩色图像。黑白图像（灰度图像）矩阵元素的取值范围通常为【0, 255】。“0”表示纯黑色，“255”表示纯白色，中间的数字从小到大表示由黑到白的过渡色。而彩色图像有24位色深=16 million种颜色。

数字化图像数据有两种存储方式：矢量图和位图
常见的图像格式有三种：
GIF，256色，压缩后不易损坏图像质量，多数用在网页上。
JPEG，经过压缩后容易损坏图像质量，多数也是用在网页上。
TIFF，标准的24位的格式，用LZW压缩，不容易损坏图像质量。所以大多期刊都接收TIFF格式的图片。
颜色模式通常分为两种：
RGB模式，它分别用红（R）、绿（G）、蓝（B）三原色的组合来表示每个像素的颜色。

CMYK模式: CMYK代表印刷上用的四种颜色，C代表青色（Cyan），M代表洋红色（Magenta），Y代表黄色（Yellow），K代表黑色（Black）。CMYK模式是最佳的打印模式。用CMYK模式编辑虽然能够避免色彩的损失，但运算速度很慢。主要因为：1、即使在CMYK模式下工作，Photoshop也必须将CMYK模式转变为显示器所使用的RGB模式。2、对于同样的图像，RGB模式只需要处理三个通道即可，而CMYK模式则需要处理四个。

权威期刊对SCI论文绘图的原则要求
原则1、分辨率
这里所讲的分辨率不是用相机拍照的总像素数，它的单位dpi（dot per inch），dpi代表了1英寸中的点数，通常不同期刊对论文配图的要求都不一样，一般情况期刊会有几个方面的要求：
line art（指黑白的矢量图），要求最高，分辨率为1200 dpi。

halftone art（半色调图像，颜色深浅有差别的灰度图，如照片、图画等），要求最低，分辨率至少为300 dpi。大家在实验阶段时就要当心保存高分辨率的图片，尤其是Western blot之类的照片。

combination art （halftone和line art的组合图），要求的分辨率是600 dpi或以上。为避免上传图片时出现困难，请不要一味地追求高分辨率，分辨率太高导致图片太大。

原则2、图片格式
科技论文中常用的图片格式有bmp、tif、wmf、emf、jpg等。对于矢量图而已，一般建议用EPS格式保存图片；halftone图片的格式通常用TIFF、TIF或PNG格式即可。投稿时一般要求图片要以独立文件形式上传。
BMP是位图，保存方法原始，体积大，质量高。
TIF兼容性好，提供预览图，缺点是体积大，但它是论文支持最广的图形文件格式，印刷后清晰度特别好。
WMF和EMF是以一种矢量图形格式，无论放大或缩小，图形的清晰度不变，所需的存储空间非常小。
JPG是一种常用的有损压缩方案，用来压缩存储批量图片，对于科技论文达到600 dpi即可。
原则3、图片大小
虽然投稿阶段没有做出严格的要求，但是一旦文章接收后，印刷排版时就要引起注意了。一般情况下只对宽度做出调整就行，单幅（单栏）在8 cm左右，全幅（双栏）在16 cm左右，不同期刊的要求略有差异。如SPRINGER出版社对图片宽度的要求，双栏在8.4 cm，单栏在17.4 cm，同时要求图片高度<23.4 cm。
原则4、色彩要求（只针对彩图）
至于配图上色彩要求，估计大家会很少注意，有两种情况：RGB用于数码设备上；CMYK为印刷业通用标准，两种情况对配图色彩要求不尽相同，有部分期刊在文章处于accepted for publication时会要求作者把图片转为CMYK色彩。然而目前有很多期刊都是网络版的（SCI-E），RGB图的确比CMYK图的效果更好，更清晰，更适合用在网络上。由RGB转为CMYK很容易，但是由CMYK转为RGB就有点难了，图片清晰度会有所下降。
特别要注意的是，尽量用白底的图片，一定不要用黑底的图。黑底图很耗墨水量，所以在抓图前将软件的背景设置为白色是很有必要的。当你只能得到黑底的图片（如条带图），可用Photoshop反相处理。
所以，平时作图时最好保存RGB的图，不论为了制作ppt报告，还是为了发表论文，RGB图片要更合适一些。
原则5、图片上的字体
一般作图时，都需要在图上加几个字，以能更清晰表达出图片的意思。多数期刊都能接受的字体是Arial、Helvetica、Calibri、Times New Roman。除此之外，还要注意图上的字能不能清晰易见，不能弄得太小，否则审稿专家和编辑会看得很痛苦。多数期刊推荐的字体大小范围是8-12 号。
总之，组图的基本原则是：有意义、有层次、美观、紧凑。
在正式组合成figure之前，一定要保存并分类好原始图片、原始数据。对不同图片可以分门别类放在不同指定的文件夹：
第1个文件夹：用以保存原始图片，主要是拍照的图片（如MRI、免疫组化图等）
第2个文件夹：用以保存原始数据，主要是EXCEL文件。
第3个文件夹：用以统计数据，主要是SPSS数据文件。
第4个文件夹：用以保存软件作图文件，主要是SPSS、GraphPad、AI、sigmaplot等，返修时可以随时用来修改原始数据。
当你组合完figure后，也可创建一个用以保存最终数据的文件夹，主要有手稿、PPT、投稿版图片，以便日后返修时可以用。
论文配图上的文字内容

标题要扼要表达、精准；缩写要与全文一致。标题和文字说明要匹配。
数字符号要与全文保持一致；XY轴表达准确，注意单位的书写。
所有图中的字号、箭头大小要保持一致，粗线、细线分明，各种线形粗细一致。

论文配图筛选原则

规范性
必要性：只放入对文章很有必要的解释说明或辅助补充作用的图。
代表性：只需选出最具代表性的图片。

事不宜迟，下面我们一起来学习各种作图软件吧。
我们做科学论文时，最常用的作图软件主要有Photoshop、PowerPoint、Origin、GraphPad等。本文介绍3种，仅供参考。
一、MS PowerPoint

PowerPoint是展示科学数据的首选工具，PPT在处理图片上应该说是最容易操作的，小编也经常用PPT整理、组合SCI论文配图。在PPT上组图，图片要以插入方式放在ppt上，千万不要直接复制，否则很难保证原始图片的分辨率。组合好图片后，可直接另存为PDF文件，然后将PDF导出为TIFF、JPG或PNG格式，同时还可自定义设置整张图片的图片分辨率。
PPT上的图片输出接口JPEG、TIFF、PNG等。

下面演示一下组图的过程。
1、当你把同一主题的数据图都排列好之后，一般只引用到PPT自带对齐方式，选中“插入图片”→“图片格式”→“对齐”→“对齐所选对象”→“顶部/底部对齐”→“横向/纵向分布”，整体调整即可。

2、全选所有图片，“图片格式”→“组合”，即可完成。

二、Adobe Photoshop
Photoshop是图片处理界的老大，功能强大，但科技论文一般只用到它的部分功能，如调节图片大小、亮度、对比度、锐度、柔和度，或颜色反向等。
Photoshop的图片输出接口有TIFF、PNG、JPEG。

PS相信大家都熟悉，下面我们用PS演示把电泳图组合的过程。
使用的软件版本：Adobe Photoshop v14.0
安装PS软件可以到Adobe官网下载程序包，安装好后就能使用了。
1、当你跑完电泳后，如果拍出来的条带图都是黑色背景，那先在PS反相调为白底。插入所选条带图→图像→调整→反相。

2、把每张黑底的条带图都调为白底后，接下来进行排列，如要比较不同蛋白基因的表达量，可以这样排列。

3、把数据图组合好之后，就是要设置图像分辨率和宽度大小了，图片大小取决于分辨率和尺寸。对于科技论文来说，一般选宽度为16 cm（二栏），分辨率300 dpi（照片）或混合图（600 dpi）。选中“图像”→“图像大小”，弹出对话框后，“宽度”填上16，注意单位是厘米，分辨率填300。

4、设置好图像大小参数后，就要保存图片了。选中“文件”→“存储为”→“保存类型”选中tiff/PNG→按“保存”确认。

三、Origin
Origin是美国Microcal公司推出的数据分析和绘图软件，其特点是使用简单，采用直观的、图形化、面向对象的窗口菜单和工具栏操作，全面支持鼠标右键和拖放式绘图。

Origin具有两大功能：数据分析和绘图。数据分析包括数据的排序、调整、计算、统计、频谱变换、曲线拟合等功能。
Origin的绘图是基于模板的，Origin本身提供了几十种二维和三维绘图模板。绘图时只要选择所需的模板即可。同时，Origin允许用户自己定制模板，如数学函数、图形样式和绘图模板等，也可用C、R语言编写数据分析程序。
Origin是一款函数绘图软件，由OriginLab公司于1991年推出的较流行的专业函数绘图软件。Origin软件有两大主要功能：数据分析和绘图。既可满足一般用户的制图需要，又可满足高级用户数据分析、函数拟合的需要。
软件的特点
操作简便，只需点击鼠标，选择菜单命令就可完成大部分工作，获得满意的结果。而且，Origin是个多文档界面应用程序。它将所有工作都保存在Project （*.OPJ）文件中。该文件可包含多个子窗口，如Worksheet，Graph，Matrix，Excel等。各子窗口之间是相互关联的，可实现数据的即时更新。子窗口可随Project文件一起存盘，也可单独存盘，以便其他程序调用。
那如何用Origin做好一张图，就要牢记9种技巧。
技巧一，善用模板主题绘图
在一张做好的图的空白处，点击右键，选择save format as theme。

重命名，并在Filters里挑选所要保存的格式（无所谓的同学请忽略），点击OK，这样我们的模板就保存完成了。

接下来我们通过一个具体的实例来学习如何调用模板主题快速作图。首先，先做出一张草图。

然后按F7，弹出Theme Organizers对话框，选中刚才保存的主题，点击Apply Now，然后Close，即可。

技巧二、搭配使用Excel制作数据处理模板
以一张电化学图的数据处理为例，原始数据的横坐标需要将参比电极由SCE转换为RHE，col(A)=col(A)+1.008，纵坐标需要将电流（A）转换为电流密度（mA cm-2），col(B)=col(B)*1000/0.247。

打开一个Excel，将sheet1重命名为电化学，把原始数据复制到Excel里，然后另起一列选中E1单元格，输入“=A1+1.008”，回车。

同理，在F1单元格中输入“=B1*1000/0.247”，回车。然后鼠标左键框选E1和F1，并将鼠标放在右下角，待鼠标变为“+”字时，按住左键拖至数据最后一行，保存Excel。

然后，如何使用Excel模板来处理数据。将原始数据导入Origin的book中，全选，复制。然后打开Excel模板，在A1单元格的位置上点击右键，粘贴。此时，处理后的数据显示在E列和F列，分别对应着原始数据中的A列和B列。选择E列和F列，复制，粘贴回Origin里，就可以使用技巧一作图了。

技巧三、修改Origin的默认初始格式
修改Origin的默认格式主要有两方面，一个是修改绘图默认格式，一个是修改字体等的默认格式。
在保存模板主题时，勾选set as system theme。以后每次plot都直接以保存的格式呈现。需要注意的是，保存模板所使用的图和要保存的格式一定要确保准确无误。

此时的坐标范围格式就不要保存为系统主题了，当然如果保存了，也可以每次都使用Rescale按钮使其重新调整刻度。

然后，是修改字体等的默认格式。点击Tools，选择Opinion。

在弹出的对话框里，text fonts标签下，就可以修改字体、颜色、字号等Origin默认格式。

技巧四、快速设置book中的列为XYXYXY
鼠标移至表头左上方，左键点击，全选数据。

右键，选择set as，一般选择XY XY。

技巧五、Y-offset处理同类型数据绘图
Book中的各列设置好XYXYXY后，全选数据，不要点击作线图，长按线图工具栏里的第五个图标，选择stacked lines by Y offsets作图（也可以通过依次点击Plot，Y-offset/Waterfall，stacked lines by Y offsets实现）。

若要调整曲线间距，双击曲线，弹出对话框，点击Offset标签，此时显示第一条曲线的Y轴偏移量为0，即不偏移。在左侧点击第二条曲线，此时可修改第二条曲线相对于第一条曲线的Y轴偏移量。同理，依次修改各条曲线的偏移量。点击Apply，可随时观察是否偏移到合适的位置。

或者，可以直接用鼠标拖动要移动的曲线。单击曲线，片刻后再次单击要移动的那条曲线，这时就选中了该条曲线，可直接按住鼠标左键上下拖动。

技巧六、Merge功能组合复杂数据
以一张xps图为例演示Merge的用法。先在不同的graph里单独画出要合并的图，然后点击Merge快捷按钮。

在弹出的对话框中设置合并效果。在Graphs里设置要合并的图以及顺序，在Rows和Columns里设置如何摆放这些图，show axes frame去掉一些多于的元素，因为是四张图垂直排列，所以垂直方向间隙vertical gap设置为0，点击ok。

删掉多余的元素，美化后，就得到了一张组合图Graph5。

技巧七、Origin工具栏快速调整字体和线条格式
绘图过程需要调节最多的就是字体和线条的格式了，这时我们可以利用Origin提供的快速工具栏来方便调节它们。

利用Ctrl或鼠标左键框选多个同类别的对象，统一利用工具栏进行调整，可以快速准确地完成作图。
技巧八、直接复制粘贴图中的元素
尽管我们保存了很多模板主题，但仍然不能穷尽所有。然而有时候当我们发现已经有一张做好的Origin图，打开它，那么它的每一个元素对象（选中，copy），以及它的格式（空白处右键，copy format），都可以被我们利用。
技巧九、直接删除错点
由于仪器环境等误差，造成原始数据出现了异常的“跳点”，这些不正常的点应该直接删去。

单击曲线，片刻后单击该点就可以选中这个点（如果一张图li95175534有多条曲线，还要点击一条曲线先选中该曲线，再选择这条曲线上的点），然后右键，选择Clear Point，可直接删掉这个点，也可以选择Edit Point来找到这个点。

应用实例，以下操作用Origin 8.5绘制
绘制简单的线图
导入 Graphing文件夹中的 AXES.OAT文件数据。
选中一列，单击菜单栏命令Plot>Line，或2D Graphs工具栏的Line.

如图所示，

绘制Y误差图
导入Curve Fitting文件的Gaussian.dat文件数据。选中一列将其设置为Y Error列，如图。

单击菜单命令【Plot】→【Symbol】一【Y Error】或2D Graphs工具栏的【Y Error】按钮。

绘制垂线图
导入Graphing文件夹中的 AXES .DAT文件数据，选中一列，单击菜单命令【Plot】→【Symbol】→【Vertical Drop Line】或2D Graphs工具栏【Vertical Drop Line】按钮。

绘制柱形图
导入 Graphing文件夹中的AXES.DAT文件数据。选中一列，单击菜单命令【Plot】→【Column/Bar/Pie】→【Column】或2D Graphs工具栏的【Column】按钮。

绘制对垒柱形图
导入 Graphing文件夹中的 Group.dat文件数据。选中一列，单击菜单命令【Plot】→【Column/Bar/Pie】→【Stack Column】或2D Graphs工具栏的【Stack Column】按钮。

绘制三角图
三角图主要用于描述X、Y、Z列所代表的量之间的比例关系，因此，理论上应满足X+Y+Z=1。如果数据表中的数据没有归一化，Origin在绘图时会自动归一化。
导入 Graphing文件夹中的 Ternary 1.dat文件数据。选中一列将其类型设置为Z，单击菜单命令【Plot】→【Specialized】→【Ternary】或2D Graphs工具栏上的【Ternary】按钮。

绘制矢量XYAM图
创建一个包含3个Y列的工作表。

选中A列,然后单击菜单命令【Column】→【Set Column Values...】，打开【Set Values】对话框,设置A列公式“cos(i-1)*2*pv50)”,范围Row(i):“1To50”，然后单击【Apply】。

单击【>>】按钮将B列设为要设置值的列，输入公式“sin(i-1)*2*pi/50)&#34;，范围默认，然后单击【Apply】按钮。

依次将C列公式设置为“(i-1)*2*pi/50”，D列设置为”1”，然后单击【OK】按钮完成设置值。

选中B、C和D三列。
单击菜单命令【Plot】→【Specialized】→【Vector XYAM】或2D Graphs工具栏上的【Vector XYAM】按钮。

绘制矢量XYXY图
1、创建一个包含两对XY列的工作表。
2、选中A列,然后单击菜单命令【 Column】→【 Set column Values...】，打开【 Set values】对话框,设置A列公式为“cos(i-1)*2*pi/50)”，范围Row(i):“1To50”，然后单击【Apply】按钮。
3、单击【>>】按钮将B列设为要设置值的列，输入公式“sin(i-1)*2*pi/50)”，范围默认,然后单击【 Apply】。
4、依次将C列公式设置为“1.2*cos((i-1)*2*pi/50)”，D列设置为“1.2*sin((i-1)*2*pi/50)”，然后单击【OK】按钮完成设置值。

5、选中A、B、C和D三列。
6、单击菜单命令【Plot】→【Specialized】→【Vector XYXY】或2D Graphs工具栏上的【Vector XYXY】按钮。

绘制含数据标签的图
1、导入Graphing文件夹中的3D Pie Chart.dat文件数据。
2、添加一个列，然后将B列数据复制到C列。
3、选中C列将其设置为标签列。
4、选中B、C两列，然后单击菜单命令【Plot】→【Column/Bar/Pie】→【Bar】或2D Graphs工具栏上的【Bar】按钮。

来源丨南博屹生物

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